Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ncapd3Q6ZQK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms