Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp34Q6ZQ93 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp34Q6ZQ93 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp34Q6ZQ93 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms