Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx55Q6ZPL9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx55Q6ZPL9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx55Q6ZPL9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms