Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M2Q6W9L1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M2Q6W9L1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms