Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Rhox8Q6VSS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Rhox8Q6VSS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Rhox8Q6VSS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms