Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sort1Q6PHU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sort1Q6PHU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sort1Q6PHU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms