Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HjurpQ6PG16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HjurpQ6PG16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HjurpQ6PG16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms