Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE1

Klhl5, Kelch-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl5Q6PFE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl5Q6PFE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl5Q6PFE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl5Q6PFE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms