Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfrlQ6PE55 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrlQ6PE55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrlQ6PE55 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms