Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85bQ6PDY0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms