Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sarm1Q6PDS3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sarm1Q6PDS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sarm1Q6PDS3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.5 ms