Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vstm2lQ6PDS0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm2lQ6PDS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms