Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgb4Q6P8W9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmgb4Q6P8W9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms