Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx19Q6P4T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx19Q6P4T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx19Q6P4T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms