Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zranb3Q6NZP1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zranb3Q6NZP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zranb3Q6NZP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb3Q6NZP1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb3Q6NZP1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zranb3Q6NZP1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb3Q6NZP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zranb3Q6NZP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms