Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdac4Q6NZM9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac4Q6NZM9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac4Q6NZM9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms