Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krba1Q6NXZ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krba1Q6NXZ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krba1Q6NXZ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krba1Q6NXZ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms