Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Frem2Q6NVD0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frem2Q6NVD0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frem2Q6NVD0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms