Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RragbQ6NTA4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RragbQ6NTA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RragbQ6NTA4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RragbQ6NTA4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RragbQ6NTA4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RragbQ6NTA4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RragbQ6NTA4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RragbQ6NTA4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms