Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc66Q6NS45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc66Q6NS45 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc66Q6NS45 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms