Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Edrf1Q6GQV7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Edrf1Q6GQV7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms