Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ltn1Q6A009 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ltn1Q6A009 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ltn1Q6A009 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms