Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ric1Q69ZJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ric1Q69ZJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ric1Q69ZJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ric1Q69ZJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ric1Q69ZJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ric1Q69ZJ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ric1Q69ZJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ric1Q69ZJ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 689.3 ms