Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp4Q68FH0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp4Q68FH0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms