Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd5Q68ED3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Papd5Q68ED3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Papd5Q68ED3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Papd5Q68ED3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms