Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1opQ66JX5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1opQ66JX5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1opQ66JX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms