Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PtprcapQ64697 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprcapQ64697 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprcapQ64697 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprcapQ64697 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms