Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja3Q64448 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja3Q64448 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja3Q64448 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms