Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifit1Q64282 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ifit1Q64282 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifit1Q64282 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit1Q64282 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms