Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd33Q63994 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd33Q63994 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms