Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2kQ63871 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms