Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vat1Q62465 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vat1Q62465 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vat1Q62465 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms