Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sp4Q62445 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp4Q62445 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms