Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nptx1Q62443 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nptx1Q62443 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms