Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl12Q62401 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl12Q62401 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms