Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnrpcQ62241 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms