Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six2Q62232 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six2Q62232 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six2Q62232 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six2Q62232 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six2Q62232 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms