Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkciQ62074 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrkciQ62074 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkciQ62074 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms