Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phox2aQ62066 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phox2aQ62066 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms