Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift88Q61371 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift88Q61371 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms