Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcanQ61361 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BcanQ61361 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BcanQ61361 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcanQ61361 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcanQ61361 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BcanQ61361 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcanQ61361 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BcanQ61361 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms