Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxd1Q61345 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd1Q61345 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd1Q61345 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms