Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nell2Q61220 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nell2Q61220 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nell2Q61220 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nell2Q61220 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nell2Q61220 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nell2Q61220 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nell2Q61220 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms