Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf9Q61179 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irf9Q61179 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf9Q61179 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms