Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamb3Q61087 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamb3Q61087 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamb3Q61087 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms