Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TmpoQ61033 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TmpoQ61033 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TmpoQ61033 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TmpoQ61033 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TmpoQ61033 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TmpoQ61033 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TmpoQ61033 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TmpoQ61033 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TmpoQ61033 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TmpoQ61033 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TmpoQ61033 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms