Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxg1Q60987 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxg1Q60987 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms