Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp4Q60972 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms