Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Meis1Q60954 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis1Q60954 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms