Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep250Q60952 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep250Q60952 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cep250Q60952 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep250Q60952 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep250Q60952 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms